生化實驗室工具包(aminoXpress)

aminoXpress是一款專為生物化學行業(yè)設計的CAD應用軟件，能夠用套用的辦法來處理用戶復雜的生物化學問題。是一款功能豐富且實用的多功能生物化學包集成。有需要的小伙伴歡迎來西西下載體驗。

軟件簡介：

aminoXpress集成了生物化學家每天執(zhí)行的常見功能。除了傳統(tǒng)的序列輸入?yún)f(xié)議之外，該程序還提供了一種新的通過構建模塊和相應計數(shù)輸入序列的協(xié)議。這為程序處理非常復雜、分支、循環(huán)和冗長的序列提供了可能性。該程序還通過其用戶可定義的片段數(shù)據(jù)庫將其適用范圍擴展到普通有機化學。

軟件功能：

1.氨基酸分析:該模塊計算氨基酸分析結果的最佳殘基比。通過將水解過程中容易氧化的殘留物輸入“未優(yōu)化殘留物”部分，可以將對優(yōu)化結果的影響降至最低。

2.復合構建模塊組成:該模塊基于構建模塊(氨基酸、片段)擁有離散的重量值這一事實來識別意外產品的身份。掃描它們的組合后，偏差最小的更有可能是衍生產品。

3.消化模式:該模塊通過用戶定義的酶或化學模式預測消化產物。

元素分析:該模塊計算序列中不同元素的理論百分比。通過進一步輸入每個元素的實驗百分比組成，可以識別其經(jīng)驗公式和/或其聚集體。

4.碎片化:該模塊預測質譜中通過三種類型的鍵斷裂產生的碎片:一氧化碳/一氧化碳、一氧化碳/碳氫化合物和碳氫化合物/碳氫化合物。生成的碎片可以直接導入到質量模塊中，用于模擬質量分布模式。

5.螺旋輪/網(wǎng):這個模塊顯示和操作螺旋結構的順序輪/網(wǎng)顯示。

6.同位素分布圖:這個模塊預測輸入公式或序列的同位素分布圖，以1到3的電荷變化的或模式

7.Lib組合庫:本模塊預測組合庫(如肽庫)的質譜，以1-3電荷的或模式進行。直到最后一步才進行質量舍入，以確保準確性。此外，該模塊將其預測能力擴展到有機文庫:隨機變體可以是氨基酸、片段或兩者兼有。結果還包括隨機的截面殘余組合

8.主題發(fā)現(xiàn):該模塊通過模式識別預測序列中潛在的藥物活性位點。它有助于掃描預設模式或隨機重復模式、潛在的藥效團，以及展示相同生物活性的加載序列。

9.分子量:這個模塊計算肽和蛋白質的分子量。輸入可以通過常規(guī)的序列方案進行，也可以通過構建模塊如氨基酸和片段進行。替代方案使模塊能夠計算復雜分子的分子量，例如具有保護基團的肽、肽模擬物、長分子和分支分子等。原子量的進一步使用通常擴展了模塊計算任何化合物分子量的能力。

輔助描述

10.數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)庫管理:這個輔助模塊允許用戶管理在這個程序中使用的所有數(shù)據(jù)庫，如氨基酸數(shù)據(jù)庫，片段附加數(shù)據(jù)庫...等等。開放式設計允許用戶根據(jù)他們的特定項目定制數(shù)據(jù)庫。

11.序列序列加載器:這個輔助模塊允許用戶將序列加載并解析到相應模塊的入口部分。專家系統(tǒng)自動識別諸如側鏈、環(huán)狀結構、假替換和附加加合物的屬性。